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obiwarp

recalage des temps de rétention en chromatographie gaz et liquide

Séquence d'appel

x2_new_rt=obiwarp(x1_master,x2_slave,score,local,nostdnrm,factors,gaps,init_penalty,response)

Paramètres

x1_master:

une structure Div ou une matrice de dimensions (n1 x q)

x2_slave:

une structure Div ou une matrice de dimensions (n2 x q)

score:

la méthode de calcul; 4 possibilités:

'cor': le coefficient de corrélation de Pearson (par défaut)

'cov' : la covariance

'prd' : le produit scalaire

'euc' : la distance Euclidienne

local:

alignement local ou global (par défaut)

nostdnrm:

par défaut les valeurs des matrices sont centrées-réduites

factors:

poids locaux appliqués respectivement aux déplacements en diagonale et dans les espaces pendant l'alignement; deux nombres entre crochets séparés par une virgule

ex: [2,1] donne un alignement non biaisé

gaps:

pénalités pour les espaces; deux nombres (valeurs initiale et étendue) entre crochets séparés par une virgule

les valeurs par défaut sont:

'cor'-> [0.3, 2.4]

'cov' -> [0,11.7]

'prd' -> [0,7.8]

'euc' -> [0.9,1.8]

init_penalty:

pénalité pour l'alignement initial (valable uniquement pour l'alignement local)

par défaut: 0

response:

réactivité de la déformation; 0 donne un calcul linéaire basé sur les points de départ et d'arrivée; 100 utilise toutes les ancres bijectives

x2_new_rt:

un vecteur de dimensions (n2 x 1)

Exemples

x2_new_rt=obiwarp(x1,x2,'cov',[],[],[2.1,1],[0,11.7],0,30);

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